教員情報詳細

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蒲池 雄介Yusuke Kamachi

  • 男性
  • 職位: 教授
  • 所属:
  • 環境理工学群
    大学院工学研究科 基盤工学専攻 物質生命システム工学コース
    大学院工学研究科 基盤工学専攻 生命科学コース

教員略歴

学位 博士(理学)
学歴 京都大学理学部 卒業(1987)
京都大学理学研究科 修了(1989)
名古屋大学理学研究科 学位取得(1993)
職歴 大阪大学細胞生体工学センター助手(1994~2002)
大阪大学生命機能研究科助教授(2002~2007)
大阪大学生命機能研究科准教授(2007~2015)
資格 第1種放射線取扱主任者免状取得(1999)
専門分野 分子発生生物学
研究室 名称 分子発生制御学研究室
詳細 動物の胚発生の過程では、細胞は時間的・空間的な制御のもとに増殖を重ねながら、一方で多様な細胞が分化により生じます。このようなプロセスが繰り返されることで、しだいに胚の組織・器官が形成されます。本研究グループでは、このような胚発生のプロセスがどのような仕組みで制御されているのかを、主として遺伝子発現調節の観点から研究しています。研究には、ゼブラフィッシュという小型熱帯魚を主に用います。
所属学会 日本分子生物学会
日本発生生物学会

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本年度担当講義

学部・学群 セミナー2(環境理工) / セミナー3(環境理工) / 卒業研究 / 発生生物学・発生工学 / 分子細胞生物学 / 細胞機能学
大学院 分子細胞生物学特論 / 特別セミナー1 / 特別セミナー2 / 生命科学演習3 / 生命科学演習4 / セミナー1 / セミナー2 / セミナー3 / セミナー4 / 特別研究 / 生命科学演習1 / 生命科学演習2

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研究シーズ

相談可能な領域 遺伝子機能の解析
現在の研究 小型魚類ゼブラフィッシュを用いた胚の発生に関する研究

動物の遺伝子発現の制御に関する研究


ゲノム操作による遺伝子機能の研究

メッセージ

研究業績

代表的な研究論文

タイトル 著者 発表誌 発表年
HiBiT-qIP, HiBiT-based quantitative immunoprecipitation, facilitates the determination of antibody affinity under immunoprecipitation conditions Ranawakage Chamila Deshani,Takuya Takada,Yusuke Kamachi Scientific Reports 2019
Cooperation of Sall4 and Sox8 transcription factors in the regulation of the chicken Sox3 gene during otic placode development Okamoto, Yu,Nishimura, Naoko,Matsuda, Kazunari,Ranawakage Chamila Deshani,Yusuke Kamachi,Kondoh, Hisato,Uchikawa, Masanori Development Growth and Differentiation,Vol.60,No.3 2018
Regulation of trunk neural crest delamination by δEF1 and Sip1 in the chicken embryo. Yasumi, T.,Inoue, M.,Maruhashi, M.,KAMACHI YUSUKE,Higashi, Y.,Kondoh, H,Uchikawa, M. Dev. Growth. Differ.,Vol.58,pp.205-214 2016
SOX2–Partner Factor Interactions and Enhancer Regulation Kondoh, H.,KAMACHI YUSUKE Sox2: Biology and Role in Development and Disease,pp.131-144 2015
Evolution of Sox2 and Functional Redundancy in Relation to Other SoxB1 Genes KAMACHI YUSUKE Sox2: Biology and Role in Development and Disease,pp.89-106 2015
Sox proteins: regulators of cell fate specification and differentiation. KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Development,Vol.140,pp.4129-4144 2013
Nano-Analysis of DNA Conformation Changes Induced by Transcription Factor Complex Binding Using Plasmonic Nanodimers. Morimura H.,Tanaka S.I.,Ishitobi H.,Mikami T.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H.,Inouye Y. ACS Nano.,Vol.23,pp.10733-10740 2013
The Pou5f1/Pou3f-dependent but SoxB-independent regulation of conserved enhancer N2 initiates Sox2 expression during epiblast to neural plate stages in vertebrates. Iwafuchi-Doi, M.,Yoshida, Y.,Onichtchouk, D.,Leichsenring M.,Driever, W.,Takemoto, T.,Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Dev. Biol.,Vol.352,pp.354-366 2011
An efficient binary system for gene expression in the silkworm, Bombyx mori, using GAL4 variants. Kobayashi, I.,Kojima, K.,Uchino, K.,Sezutsu, H.,Iizuka, T.,Tatematsu, K.,Yonemura, N.,Tanaka, H.,Yamakawa, M.,Ogura, E.,KAMACHI YUSUKE,Tamura, T. Arch. Insect. Biochem. Physiol.,Vol.76,pp.195-210 2011
B1 SOX coordinate cell specification with patterning and morphogenesis in the early zebrafish embryo. Okuda, Y.,Ogura, E.,Kondoh, H.,KAMACHI YUSUKE PLoS Genet.,Vol.6,No.5,pp.e1000936 2010
SOX-partner code for cell specification: Regulatory target selection and underlying molecular mechanisms. Kondoh, H.,KAMACHI YUSUKE Int J Biochem Cell Biol.,Vol.42,pp.391-399 2010
Adaptation of GAL4 activators for GAL4 enhancer trapping in zebrafish. Ogura, E.,Okuda, Y.,Kondoh, H.,KAMACHI YUSUKE Dev. Dyn.,Vol.238,pp.641-655 2009
Evolution of non-coding regulatory sequences involved in the developmental process: reflection of differential employment of paralogous genes as highlighted by Sox2 and group B1 Sox genes. KAMACHI YUSUKE,Iwafuchi, M.,Okuda, Y.,Takemoto, T.,Uchikawa, M.,Kondoh, H. Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci,Vol.85,pp.55-68 2009
Interplay of Pax6 and SOX2 in lens development as a paradigm of genetic switch mechanisms for cell differentiation. Kondoh, H.,Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE Int. J. Dev. Biol.,Vol.48,pp.819-827 2004
Efficient identification of regulatory sequences in the chicken genome by a powerful combination of embryo electroporation and genome comparison. Uchikawa, M.,Takemoto, T.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Mech. Dev.,Vol.121,pp.1145-1158 2004
Pairing SOX off with partners in the regulation of embryonic development. KAMACHI YUSUKE,Uchikawa, M.,Kondoh, H. Trends Genet.,Vol.16,pp.182-187 2000
Analysis of protein interactions with two-hybrid system in cultured insect cells. Mon, H.,Sugahara, R.,Hong, S.M.,Lee, J.M.,KAMACHI YUSUKE,Kawaguchi, Y.,Kusakabe, T. Anal. Biochem.,Vol.392,pp.180-182 2009
Quantitative assessment of the knockdown efficiency of morpholino antisense oligonucleotides in zebrafish embryos using a luciferase assay. KAMACHI YUSUKE,Okuda, Y.,Kondoh, H. Genesis,Vol.46,pp.1-7 2008
Comparative genomics approach to the expression of figα, one of the earliest marker genes of oocyte differentiation in medaka (Oryzias latipes). Kanamori, A.,Toyama, K.,Kitagawa. S.,Kamehara. A.,Higuchi. T.,KAMACHI YUSUKE,Kinoshita. M.,Hori. H. Gene,Vol.423,pp.180-187 2008
PAX6 and SOX2-dependent regulation of the Sox2 enhancer N-3 involved in embryonic visual system development. Inoue, M.,KAMACHI YUSUKE,Matsunami, H.,Imada, K.,Uchikawa, M.,Kondoh, H. Genes Cells,Vol.12,pp.1049-1061 2007
Triggering neural differentiation of ES cells by subtype switching of importin-α. Yasuhara, N.,Shibazaki, N.,Tanaka, S.,Nagai, M.,Kamikawa, Y.,Oe, S.,Asally, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H.,Yoneda, Y. Nat. Cell. Biol.,Vol.9,pp.72-79 2007
Hypogonadotropic hypogonadism in an adult female with a heterozygous hypomorphic mutation of SOX2. Sato, N.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H.,Shima, Y.,Morohashi, K.,Horikawa, R,Ogata, T. Eur. J. Endocrinol.,Vol.156,pp.167-171 2007
Convergence of Wnt and FGF signals in the genesis of posterior neural plate through activation of the Sox2 enhancer N-1. Takemoto, T.,Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Development,Vol.133,pp.297-306 2006
Comparative genomic and expression analysis of group B1 sox genes in zebrafish indicates their diversification during vertebrate evolution. Okuda, Y.,Yoda, H.,Uchikawa, M.,Furutani-Seiki, M.,Takeda, H.,Kondoh, H.,KAMACHI YUSUKE Dev. Dyn.,Vol.235,pp. 811-825 2006
Functional analysis of the chicken delta1-crystallin enhancer activity in Drosophila reveals remarkable evolutionary conservation between chicken and fly. Blanco, J.,Girard, F.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H.,Gehring, WJ. Development,Vol.132,pp.1895-1905 2005
Multiple N-cadherin enhancers identified by systematic functional screening indicate its Group B1 SOX-dependent regulation in neural and placodal development. Matsumata, M.,Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Dev. Biol.,Vol.286,pp.601-617 2005
Interplay of SOX and POU factors in regulation of the Nestin gene in neural primordial cells. Tanaka, S.,KAMACHI YUSUKE,Tanouchi, A.,Hamada, H,Jing N.,Kondoh, H. Mol. Cell. Biol.,Vol.24,pp.8834-8846 2004
Functional analysis of chicken Sox2 enhancers highlights an array of diverse regulatory elements that are conserved in mammals. Uchikawa, M.,Ishida, Y.,Takemoto, T.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Dev. Cell,Vol.4,pp.509-519 2003
Distinct roles of SOX2, Pax6 and Maf transcription factors in the regulation of lens-specific δ1-crystallin enhancer. Muta, M.,KAMACHI YUSUKE,Yoshimoto, A.,Higashi, Y.,Kondoh, H. Genes Cells,Vol.7,pp.791-805 2002
Chromosome assignment of eight SOX family genes in the chicken. Kuroiwa, A.,Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H.,Nishida-Umehara, C.,Masabanda, J.,Griffin, K.D.,Matsuda, Y. Cytogenet. Genome Res.,Vol.98,pp.189-193 2002
Pax6 and SOX2 form a co-DNA-binding partner complex that regulates initiation of lens development. KAMACHI YUSUKE,Uchikawa, M.,Tanouchi, A.,Sekido, R.,Kondoh, H Genes Dev.,Vol.15,pp.1272-1286 2001
Sox18 expression in blood vessel and feather buds during chicken embryogenesis. Olsson, J.E.,KAMACHI YUSUKE,Penning, S.,Muscat, G.E.O.,Kondoh, H.,Koopman, P. Gene,Vol.271,pp.151-158-151-158 2001
Two distinct subgroups of Group B Sox genes for transcriptional activators and repressors: their expression during embryonic organogenesis of the chicken. Uchikawa, M.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Mech. Dev.,Vol.84,pp.103-120-103-120 1999
Mechanism of regulatory target selection by the SOX high-mobility-group domain proteins as revealed by comparison of SOX1/2/3 and SOX9. KAMACHI YUSUKE,Cheah, K.S.E.,Kondoh, H Mol. Cell. Biol.,Vol.19,pp.107-120 1999
Identification and functional analysis of the mouse filensin gene promoter. Masaki, S.,KAMACHI YUSUKE,Quinlan, R.O.,Yonezawa, S.,Kondoh, H. Gene,Vol.214,pp.77-86 1998
Involvement of Sox1, 2 and 3 in the early and subsequent molecular events of lens induction. KAMACHI YUSUKE,Uchikawa, M.,Collignon, J.,Lovell-Badge, R.,Kondoh, H. Development,Vol.125,pp.2521-2532 1998
Two mechanisms in the action of repressor δEF1: binding site competition with an activator and active repression. Sekido, R.,Murai, K.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Genes Cells,Vol.2,pp.771-783 1997
A murine Thy-1.2 reporter vector containing a SV40 origin for rapid cloning and analysis of eukaryotic promoters. Kadokawa, Y.,Kusakabe, T.,KAMACHI YUSUKE,Isobe, K.,Kondoh, H.,Ohyama, T. Gene,Vol.153,pp.277-278 1995
Involvement of SOX proteins in lens-specific activation of crystallin genes. KAMACHI YUSUKE,Sockanathan, S.,Liu, Q.,Breitman, M.,Lovell-Badge, R.,Kondoh, H. EMBO J.,Vol.14,pp.3510-3519 1995
The δ-crystallin enhancer-binding protein δEF1 is a repressor of E2-box-mediated gene activation. Sekido, R.,Murai, K.,Funahashi, J.,KAMACHI YUSUKE,Fujisawa, A.,Nabeshima, Y.,Kondoh, H. Mol. Cell. Biol.,Vol.14,pp.5692-5700 1994
δ-crystallin enhancer binding protein δEF1 is a zinc finger- homeodomain protein implicated in postgastrulation embryogenesis. Funahashi, J.,,Sekido, R.,Murai, K.,KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Development,Vol.119,pp.433-446 1993
Overlapping positive and negative regulatory elements determine lens-specific activity of the δ1-crystallin enhancer. KAMACHI YUSUKE,Kondoh, H. Mol. Cell. Biol.,Vol.13,pp.5206-5215 1993
Identification of nuclear factor δEF1 and its binding site essential for lens-specific activity of the δ1-crystallin enhancer. Funahashi, J.,KAMACHI YUSUKE,Goto, K.,Kondoh, H. Nucleic Acids Res.,Vol.19,pp.3543-3547 1991
Purification of a mouse nuclear factor that binds to both the A and B cores of the polyomvirus enhancer. KAMACHI YUSUKE,Ogawa, E.,Asano, M.,Ishida, S.,Murakami, Y.,Satake, M.,Ito, Y.,Shigesada, K. J. Virology,Vol.64,pp.4808-4819 1990
発生と細胞分化 蒲池 雄介 分子生物学 第3版,pp.176-190 2011
クリスタリン遺伝子の発現制御から解明された水晶体分化 内川 昌則,蒲池 雄介,近藤 寿人 蛋白質核酸酵素,Vol.50,pp.655-663 2005
SOX とパートナー因子による転写調節機構 内川 昌則,蒲池 雄介,近藤 寿人 細胞工学,Vol.20,pp.729-739 2001
動物細胞へのDNAの導入 蒲池 雄介,近藤 寿人 分子生物学プロトコール(改訂第2版),pp.225-235 1999
SOXタンパク質によるクリスタリン遺伝子の発現調節と水晶体分化 蒲池 雄介 蛋白質核酸酵素,Vol.41,pp.1113-1123 1996
転写制御因子の発現クローニングのデザイン 蒲池 雄介,後藤 弘爾,磯部 健一,中島 泉,近藤 寿人 実験医学,Vol.10,pp.1663-1667 1992
トランスフェクションと電気穿孔法 蒲池 雄介 新生化学実験講座,Vol.14,pp.340-346 1992

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科学研究費

KAKENは国立情報学研究所が行っているサービスです。

区分 研究課題 研究種目 研究期間 課題番号
代表 Sox転写因子とmicroRNAが構成する遺伝子制御ネットワークの解明 基盤研究(B) 2013/04/01 - 2017/03/31 25290066
代表 タンパク質とゲノムの相互作用を組織特異的に検出する方法の開発と応用 挑戦的萌芽研究 2015/04/01 - 2018/03/31 15K14527
代表 発生における分化スイッチを担うSoxパートナー因子複合体のin vivo作用機構 基盤研究(C) 2018/04/01 - 2021/03/31 (予定) 18K06267

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社会貢献及び広報活動